Das neue Cargo Terminal befindet sich in unmittelbarer Nähe der A35 in Frankreich, der A2 und A3 in der Schweiz sowie der A5 in Deutschland. Die Grundfläche ist in sieben Module mit je 3'000 m2 aufgeteilt. Dazu kommen 6‘000 m2 an Bürofläche auf zwei Stockwerken, sowie Parkplätzen für Camions und Personenwagen. Auf dem Vorfeld innerhalb des Flughafenareals sind vorerst zwei Stellplätze für Grossraum-Frachter vorgesehen. Wie am EuroAirport üblich, hat auch das neue Cargo-Terminal einen Schweizer und einen französischen Bereich.