Heliopolis Airlines wird nach der Wintersaison und dem Zusammenbruch des Aegypten-Tourismus ihre eigenen Flugoperationen vorerst einstellen.Anfangs 2000 wird sie durch die Flash Group übernommen und als Flash Airlines weiter firmieren, dann mit Boeing 737-300. Am 2. Januar 2004 wird jedoch eine ihrer Maschinen nach dem Start in Sharm-el-Sheikh abstürzen und 148 Menschen in den Tod reissen. Als Folge des Unglücks wird Flash Airlines den Betrieb bereits zwei Monate später einstellen.