Lufthansa hatte schon immer ein etwas unklares Verhältnis zu seiner Commuter-Flotte, mit einigen Wechseln der Gesellschaften, Bemalungen und Beschriftungen. Aktuell erhalten alle Maschinen mit dem Kranich im Heck auch Lufthansa-Aufschriften, während die ehemaligen Eurowings-Maschinen noch die Bemalung und Titel der Lufthansa Regional weiterführen. Die CRJ 900 D-ACKJ «Ilmenau» gehört seit Oktober 2006 zur Flotte der Lufthansa CityLine.