Immer wieder gibt es auf dem Flughafen Basel-Mulhouse sehr seltene Privatflugzeuge zu sehen, auch bereits anfangs der 1960er Jahre. Diese Morane-Saulnier MS.732 Alcyon ist als OO-TYB in Belgien eingetragen.
Die ERCO 415 Ercoupe D-EMYN dient offenbar als Werbeträger und vermutlich als Firmenflugzeug für die Trix Vereinigte Spielwarenfabriken E.Voelk K.G. Nürnberg, einen bekannten Hersteller auch von Modelleisenbahnen.
Während vielen Jahren ist die Nord Aviation Norécrin II als HB-DAO in der Schweiz eingetragen und besucht in dieser Zeit oft auch den Flugplatz Basel-Mulhouse.
Auf dem Flugplatz Basel-Mulhouse ist die Messerschmitt BF 108 Taifun HB-HOL zu sehen. Obwohl diese Maschine zivil registriert ist, gehört sie laut dem Eidgenössischen Luftamt zur Flotte des Militärdepartments.
Die Flugschulung erfolgt auch am Flugplatz Basel-Mulhouse mehrheitlich auf Maschinen des Typs Piper J3C/L-4 Cub, welche aus Beständen der amerikanischen Streitkräfte stammen.
Die Piper J3C/L-4 Cub gehört der Flugschule Basel und ist eine von mehreren Maschinen dieses Typs, welche ab dem Flugplatz Basel-Mulhouse für die Pilotenschulung eingesetzt werden.
Seit 1958 setzt Balair die Cessna 170B HB-COM ein. Besonders an den Wochenenden ist sie oft aktiv, auf Stadt- und Jurarundflügen ab dem Flugplatz Basel-Mulhouse.
Die Fairchild 24 Argus II HB-EIM gehört seit 1954 zur Flotte der Klein- und Spezialflugzeuge der Balair. Sie wird bis 1958 für Schulungsflüge und als Taxiflugzeug ab dem Flugplatz Basel-Mulhouse eingesetzt.
