Im Auftrag der Air France fliegt Proteus Airlines an Werktagen zweimal täglich nach Rennes. Eingesetzt werden Beechcraft 1900D, wie hier die F-GPSD, die ungewöhnlicherweise keine Titel von Proteus Airlines erhalten hat.

Auch der Embraer 135 F-GOHF trägt weiterhin die Titel von Proteus Airlines, nun bereits Teil der Régional Compagnie Aérienne, die zahlreiche Regionaljets von Embraer im Auftrag der Air France betreibt.

Air France lässt den Embraer 145 F-GUAM durch die Régional Compagnie Aérienne betreiben, auch zwischen Lyon und dem EuroAirport. Neben vollen Air France-Farben trägt er die Titel der Proteus Airlines.

Von und nach Clermont Ferrand setzt Air France oft die von Proteus Airlines betriebenen Embraer Brasilia ein. Die F-GHIB trägt die Bemalung der Air France mit zusätzlichen Titel der Proteus Airlines.

Zwischen dem EuroAirport und Paris-Orly setzt Air France nun auch Fokker 100 von Proteus Airlines ein.

Proteus Airlines betreibt die Beechcraft 1900D F-GUCB im Auftrag der Air France und in deren vollständigen Bemalung, mit einem kleinen Logo und Titel von Proteus Airlines unterhalb des Cockpits.

Auf einem Linienflug der Air France aus Lyon kommt die Beechcraft 1900C F-GNAJ der aufstrebenden Proteus Airlines zum Einsatz.